COBOL2002で決められた文字コードが使用できます。Windowsの場合は，シフトJISコードが使用できます。UNIXの場合は，マニュアル「COBOL2002　使用の手引　手引編」を参照してください。また，環境変数CBLJ2CBOPTのencode指定によって，エンコードに従った文字コード体系に変換することもできます。文字コードの設定方法については「5.4　COBOLアクセスの環境変数の設定」，encode指定については「5.4.4　encodeオプション」を参照してください。

また，Windows，AIX，Linux(x86)，またはLinux(x64)の場合，unicode指定によってUnicodeを使用することもできます。unicode指定については「5.4.8　unicodeオプション（Windows，AIX，Linux(x86)，Linux(x64)の場合）」を参照してください。