J2EEサーバ上で実行できるアプリケーションを，J2EEアプリケーションといいます。WAR形式のWebアプリケーション，またはEJB-JAR形式のEJBアプリケーションをJ2EEサーバで実行するためには，J2EEアプリケーションとしてデプロイする必要があります。J2EEサーバ上で実行できるJ2EEアプリケーションは，次に示す2種類です。

• アーカイブ形式のJ2EEアプリケーション
  EJBやサーブレットなどのアプリケーションの実体をJ2EEサーバの作業ディレクトリに持つJ2EEアプリケーションです。
  
• 展開ディレクトリ形式のJ2EEアプリケーション
  EJBやサーブレットなどのアプリケーションの実体を，J2EEサーバの外部にある一定のルールに従ったファイル／ディレクトリに持つJ2EEアプリケーションです。
  

12.3以降で，それぞれの形式のJ2EEアプリケーションのデプロイについて説明します。また，J2EEアプリケーションの実行機能として，J2EEアプリケーションのリデプロイ，J2EEアプリケーションの更新検知とリロードについても説明します。

なお，システムの運用を開始したあとでJ2EEアプリケーションの運用中に使用する機能については，マニュアル「Cosminexus アプリケーションサーバ 機能解説 運用／監視／連携編」の「5.　J2EEアプリケーションの運用」を参照してください。